Образована в 1983 Энтони Кидисом (Anthony Kiedis) (р. 1 ноября 1962, Гранд-Рапидс, шт. Мичиган) и Фли (Flea) (настоящее имя Мишель Балзари, Michael Balzary) (р. 16 октября 1962, Мельбурн, Австралия).

Основана в Лос-Анджелесе. В 1984 был выпущен их первый альбом, следом за ним в 1985 — второй (оба не имели не успеха). Однако группа постепенно обрастала скандальной известностью, главным образом благодаря своему эпатирующему поведению (на концертах музыканты часто появлялись голыми, неоднократно арестовывались за сексуальные домогательства). Музыка двух последующих альбомов The Uplift Mofo Party (1987) и Abbey Road EP (1988) с кавер-версией композиции Джимми Хендрикса Fire была исполнена в более агрессивной манере, альбомы стали популярны.
В 1988 от передозировки героина скончался один из участников группы, гитарист Хиллел Словак, а позже коллектив покинул барабанщик Джек Айронз. Однако группа не распалась. В обновленном составе она записала в 1988 альбом Mother's Milk и стала знаменитой; их видеоклипы на песню Knock Me Down и кавер-версия Higher Ground Стиви Уандера начали с успехом транслироваться на MTV.
Диск Blood Sugar Sex Magic (1991) был выпущен тиражом более 3 млн. Особо популярной стала записанная на нем песня Give It Away. В 1992 группа отправилась в большое гастрольное турне. На фестивале в Вудстоке в 1994 музыканты по прежнему эпатировали публику, выйдя на сцену с огромными электрическими лампочками на головах.
После некоторого перерыва в 1995 был выпущен альбом One Hot Minute, получившийся менее успешным, чем Blood Sugar Sex Magic; в 1996 записана кавер-версия диско-сингла Love Rollercoaster, занявшая высокие места в чартах. В 1999 вышел новый альбом Californication с мультиплатиновым хитом Scar Ti, а в 2002 — альбом By The Way.
Музыканты остепенились, серьезно занялись своим здоровьем и семьями и во время концертов больше не раздеваются.